计算机学科专业始建于1979年，设有应用数学、计算机软件专业。最初的师资来自天津大学、南开大学、国防科技大学等重点大学，后又分批选送青年教师到南京大学、中科院、上海交通大学进修，1983年培养出本市第一批计算机软件专业毕业生。
1984年成立数学系
1987年更名为计算机与数学系
1996年更名为计算机科学与工程系
2006年更名为计算机科学与技术学院
2008年更名为计算机与通信工程学院
2017年更名为计算机科学与工程学院
